Application of the real-time PCR Taqman allelic discrimination assay for the detection of Isoniazid and/or Rifampicin resistant Mycobacterium Tuberculosis from clinical samples

Tạp chí Y Dược học - Tập 13 (04) năm 2023

Application of the real-time PCR Taqman allelic discrimination assay for the detection of Isoniazid and/or Rifampicin resistant Mycobacterium Tuberculosis from clinical samples

2023 - Tập 13 (04), trang 72

DOI: 10.34071/jmp.2023.4.10

Tóm tắt

Background: Drug-resistant Tuberculosis (DR-TB) is challenging public health problem in countries with high tuberculosis prevalence and limited resources. Developing and applying the most appropriate and effective methods for diagnosing DR-TB from clinical samples is necessary, allowing a more rapid detection method for large-scale screening.

Methods: Applying real-time PCR Taqman allelic discrimination with a PCR Taqman probes panel to identifying the DR-TB associated mutations in rpoB and katG of Mycobacterium Tuberculosis from isolates and clinical samples.

Results: Comparing results of the real-time PCR allelic and DNA sequencing results, the sensitivity and specificity for Isoniazid resistance detection by analysing katG were found 95%(75.1 - 99.8) and 100%, Rifampicin resistance determining region (RRDR) of rpoB were found 95.5(77.16 - 99.88) and 100%, respectively. The real-time PCR TaqMan allelic discrimination also showed the sensitivities 100% for both katG and rpoB, and the specificities were 93.55% (78.58 - 99.21) for the rpoB and 93.94% (79.77 - 99.26) for the katG from clinical samples.

Conclusions: This study showed that the real-time PCR taqman allelic discrimination assay is useful for detection of TB and DR-TB because of an accurate and rapid diagnosis in the early stages.

Từ khoá

rug-resistant Tuberculosis clinical samples real-time PCR taqman allelic discrimination assay Mycobacterium tuberculosis.

Toàn văn

PDF

Trích dẫn bài báo

Nguyen Thi Binh Nguyen, Tran Thi Hong Van, Nguyen Thi Kieu Diem, Truong Van Hue, Tran Tuyet Ngoc, Phan van Bao Thang, Nguyen Thi Tuyen, Nguyen Hoang Bach, Mai Van Tuan, Paola Molicotti, Ngo Viet Quynh Tram. (2023). Application of the real-time PCR Taqman allelic discrimination assay for the detection of Isoniazid and/or Rifampicin resistant Mycobacterium Tuberculosis from clinical samples. Tạp chí Y Dược học, , 72. DOI: 10.34071/jmp.2023.4.10

Trong số này

In vitro study of effective factors for the inhibitory assay on pancreatic lipase

Tran The Huan, Ho Thi Thu Trang, Cao Thi Cam Nhung, Ho Hoang Nhan, Tran Thai Son

Siêu âm đánh dấu mô cơ tim: nguyên lý hoạt động và ứng dụng lâm sàng

Nguyen Nguyen Trang, Nguyen Anh Vu, Le Van Chi

Tình trạng bộc lộ protein sửa chữa ghép cặp sai (mmr) ở bệnh nhân ung thư biểu mô dạ dày

Nguyen Thi Hong Chuyen, Nguyen Thi Thu Giang, Nguyen Thanh Phuc, Ngo Quy Tran, Dang Cong Thuan

Khảo sát tình hình bệnh nha chu ở trẻ độ tuổi mầm non tại thành phố Huế

Tran Tan Tai, Hoang Minh Phuong, Le Van Nhat Thang, Nguyen Gia Kieu Ngan, Nguyen Thi Lan Phuong, Nguyen Thi Thuy Duong, Hoang Vu Minh

Thành phần hoá học và hoạt tính gây độc tế bào của phân đoạn n-hexane của loài thiên niên kiện lá lớn (Homalomena pendula)

Nguyen Khanh Thuy Linh, Nguyen Thi Hoai, Tran Thi Van Anh, Ho Viet Duc

Current status of scientific research of nursing students at Hue University of Medicine and Pharmacy

Nguyen Hoang Long, Tran Thi Thao, Hoang Thi Phuong Thao, Pham Thi Khanh Linh, Ton Nu Minh Duc, Nguyen Thi Anh Phuong, Ho Thi Thuy Trang

Hoạt tính kháng viêm và ức chế tế bào ung thư của các hợp chất phân lập từ cây tỏi đá ba tia (Aspidistra triradiata N. Vislobokov)

Le Thi Bich Hien, Ho Viet Duc, Tran Thi Van Anh, Nguyen Thi Hoai

Đánh giá hiệu quả dự phòng tụt huyết áp của hai liều phenylephrin tiêm tĩnh mạch sau gây tê tủy sống để phẫu thuật lấy thai

Le Van Tam, Duong Thi Ngoc Anh, Tran Xuan Thinh, Nguyen Van Minh

Maternal and neonatal outcome in preterm premature rupture of membranes

Truong Thi Linh Giang, Vo Quang Tan

Đánh giá kết quả điều trị răng viêm quanh chóp không triệu chứng bằng Tricalcium silicate

Phan Anh Chi, Le Thi Thu Nga

Khảo sát tình hình nhiễm giun sán một số vật nuôi ở Thừa Thiên huế và hiệu quả của biện pháp hấp khử nhiễm để dự phòng lây nhiễm giun sán trong phòng xét nghiệm

Nguyen Thi Mong, Tran Thao Nhi, Tran Thi Giang, Nguyen Phuoc Vinh, Ngo Thi Minh Chau, Ton Nu Phuong Anh

Khảo sát đặc điểm mạch máu củng mạc mắt theo phương pháp mục chẩn của y học cổ truyền trên bệnh nhân đau vai gáy

Doan Van Minh, Nguyen Thi Kim Lien, Nguyen Quang Tam, Vo Thi Minh Nguyet, Truong Huu Thien Tri, Nguyen Van Hung, Nguyen Thi Huong Lam

Evaluating the effectiveness and applicability of ubiquitous-based learning about post-operative care of gastrointestinal cancer surgery for patients’ family caregivers

Vo Thi Bich Nga, Nguyen Thi May, Vo Thi Diem Binh, Ho Thi Thuy Trang, Nguyen Thi Anh Phuong

Nghiên cứu nồng độ kháng nguyên đặc hiệu tuyến tiền liệt trong huyết thanh của nam giới ≥ 50 tuổi bị tăng sinh lành tính tuyến tiền liệt và một số yếu tố liên quan

Nguyen Truong An, Dinh Van Tai, Le Dinh Dam, Nguyen Nhat Minh, Le Dinh Khanh

Chẩn đoán ung thư phổi không tế bào nhỏ giai đoạn I-IIIA bằng chụp cắt lớp vi tính ngực

Hoang Huu, Pham Hung Cuong

Đánh giá kỹ thuật sinh ống mầm trong định danh nấm Candida albicans bằng các môi trường khác nhau

Ngo Thi Minh Chau, Nguyen Nhu Quynh, Nguyen Thi Phuong Thao

Knowledge and practice in respect of medical solid waste management among healthcare workers at Quang Nam Northern Mountainous Region General Hospital

Nguyen Cong Xinh, Tran Van Vui, Nguyen Thi Dang Thu, Dang Thi Anh Thu

Kết quả phẫu thuật cắt rộng ung thư da tế bào đáy vùng mặt kèm tạo hình bằng vạt tại chỗ

Nguyen Tran Thuc Huan, Tran Thi Nhu, Le Thanh Huy, Nguyen Thi Hong Chuyen, Ha Thanh Thanh

Nghiên cứu chất lượng tinh trùng nam giới ở những cặp vợ chồng vô sinh và một số yếu tố liên quan theo y học cổ truyền

Nguyen Quang Tam, Nguyen Thi Kim Lien, Le Minh Tam, Doan Van Minh

Đặc điểm hình ảnh và giá trị của cắt lớp vi tính đa dãy trong chẩn đoán chấn thương kín ống tiêu hóa, mạc treo

Dau Le Thuy, Hoang Thi Quyen, Nguyen Quoc Huy, Ho Khanh Duy, Pham Minh Dung

Characteristics of the carotid intima-media thickness and atherosclerotic plaques of carotid arteries in elderly people with rheumatoid arthritis at University Medical Center Ho Chi Minh City

Cao Thanh Ngoc, Dang Ngoc Son

Nghiên cứu một số yếu tố liên quan đến tử vong ở trẻ sơ sinh cực non tại Bệnh viện Phụ sản-Nhi Đà Nẵng

Tran Thi Hoang, Pham Thi Nhu Thuy

Khảo sát tình trạng sâu răng sữa ở trẻ 2 - 4 tuổi tại một số trường mầm non, quận ngũ hành sơn, thành phố Đà Nẵng năm 2022

Nguyen Thi Thuy Duong, Nguyen Thi Tra Loc

Nghiên cứu tình trạng rối loạn điện giải huyết thanh ở trẻ sinh ngạt

Nguyen Thi Thanh Binh, Nguyen Thi Phuong Thao, Tran Binh Thang

Comparison of full-mouth and partial-mouth disinfection modalities in nonsurgical periodontal treatment for periodontitis: a randomized clinical trial in Vietnam

Nguyen Thi Thuy Duong, Tran Thi To Uyen

Phân tích hình ảnh vi cấu trúc chất trắng ở bệnh nhân đau nửa đầu: nghiên cứu thử nghiệm bước đầu

Hoang Ngoc Thanh, Nguyen Thanh Thao

Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng lymphôm tế bào T nguyên phát ở da

Tran Huong Giang, Pham Van Hung, Nguyen Thanh Tu

Nghiên cứu bào chế vi cầu kiểm soát giải phóng kết dính niêm mạc chứa metronidazole

Le Thi Thanh Ngoc, Ha Xuan Kiet, Nguyen Hong Trang

In vitro fertilization outcomes In infertile women with adenomyosis

Tran Ngoc Ha Giang, Le Minh Tam

Đánh giá in vitro độ chính xác của máy định vị chóp răng thế hệ thứ 4 Apex ID

Hoang Trong Danh, Nguyen Duc Quynh Trang, Nguyen Thi Thuy Duong

Nghiên cứu áp dụng thang điểm Heart trong phân tầng nguy cơ bệnh nhân đau ngực vào Trung tâm Cấp cứu - đột quỵ, Bệnh viện Trường Đại học Y - Dược Huế

Nguyen Khanh Huy

Nghiên cứu áp dụng kỹ thuật sinh thiết bằng kim nhỏ dưới hướng dẫn hướng dẫn của nội soi siêu âm ở bệnh nhân u tụy

Trinh Pham My Le, Ho Dang Quy Dung, Tran Dinh Tri, Tran Van Huy

Optimization and physicochemical characterization of polymeric nanoparticles containing tinidazole

Ho Hoang Nhan, Le Hoang Hao, Ho Thi Thu Hue, Phan Thi Thao Ngoc

Nghiên cứu một số đặc điểm trẻ thở máy tại Trung tâm Nhi khoa, Bệnh viện Trung ương Huế

Nguyen Duy Nam Anh

Nhận xét đặc điểm lâm sàng và các yếu tố liên quan đến tình trạng viêm nha chu mạn tính trên bệnh nhân đến khám tại Bệnh viện Trường Đại học Y Dược Huế

Tran Thi To Uyen, Nguyen Thi Thuy Duong

Nghiên cứu đặc điểm sơ sinh cân nặng dưới 1500 gram tại Trung tâm Nhi - Bệnh viện Trung ương Huế

Hoang Nguyet Quynh, Nguyen Thi Cu, Hoang Mai Linh, Nguyen Thi Thao Trinh

Ảnh hưởng của dịch chiết cây Giảo cổ lam (Gynostemma pentaphyllum) lên quá trình phát sinh tinh ở chuột stress nhiệt độ cao

Nguyen Thanh Tung, Nguyen Thi Khanh Quynh

Nghiên cứu hiệu quả điều trị của Infliximab trên bệnh nhân viêm khớp cột sống

Vo Thi Hoai Huong, Nguyen Hoang Thanh Van, Vo Tam

Tình hình một số bệnh lý ống tiêu hoá - gan mật tuỵ đến khám và điều trị nội trú tại Bệnh viện đại học Y Dược Buôn Ma Thuột năm 2022

Kieu Thi Phuong Nhan, Vo Minh Thanh, Tran Van Huy

Nghiên cứu bào chế hệ tự vi nhũ hóa chứa ibuprofen dùng đường uống

Ho Hoang Nhan, Tran Nu Tra My, Le Thi Minh Nguyet

Nghiên cứu đặc điểm lâm sàng, hóa sinh và hình ảnh siêu âm nội soi khối u tụy

Vinh Khanh, Luong Viet Thang, Tran Van Huy

Hiệu quả làm sạch calcium hydroxide trong ống tủy của phương pháp bơm rửa kết hợp trâm quay protaper và bơm rửa siêu âm: nghiên cứu in vitro

Nguyen Thi Thuy Duong, Nguyen Duc Quynh Trang, Nguyen Thi Nhat Vy

Assessment of health-related quality of life among outpatients with asthma at Hue University of Medicine and Pharmacy Hospital

Vo Thi Hong Phuong, Nguyen Thi Ngoc Quyen, Ngo Thi Kim Cuc, Phan Dang Thuc Anh, Hoang Thi Lan Huong, Nguyen Phuoc Bich Ngoc

Nghiên cứu các hình thái lâm sàng và thái độ xử trí ở những sản phụ có nhiễm trùng hậu sản

Truong Thi Linh Giang

Mối liên quan giữa teo niêm mạc dạ dày trên nội soi theo phân loại Kimura - Takemoto với đặc điểm mô bệnh học ở bệnh nhân viêm dạ dày mạn có Helicobacter pylori

Phan Trung Nam, Nguyen Thi Huyen Thuong

Ung thư biểu mô tế bào gan giai đoạn tiến triển: liệu có thể chỉ định điều trị tại chỗ?

Chau Thi Hoang Anh, Le Trong Binh

Development and physicochemical characterization of solid lipid nanoparticles containing tinidazole

Ho Hoang Nhan, Le Thi Thanh Ngoc, Le Hoang Hao, Tran Thi Kieu Ny, Dao Anh Tuan

Bước đầu phân loại u lympho dạ dày - ruột dựa trên mô bệnh học và hóa mô miễn dịch

Dang Cong Thuan, Nguyen Duy Thinh, Nguyen Tran Bao Song, Nguyen Van Mao, Phan Trung Nam, Ngo Quy Tran, Tran Thi Nam Phuong, Nguyen Thanh Tung, Le Thi Tam, Le Vi, Tran Thi Hoang Lien

Đặc điểm phân bố bệnh tật của bệnh nhân điều trị nội trú tại Bệnh viện ung bướu Hà Nội trong giai đoạn 2017 - 2019

Nguyen Thi Ngoc Ha, Pham Anh Tuan, Nguyen Khanh Ha

Nghiên cứu khoảng tham chiếu dấu ấn chu chuyển xương ở phụ nữ chưa mãn kinh tại Bệnh viện Đại học Y Dược thành phố Hồ Chí Minh

Cao Thanh Ngoc, Tran Hong Thuy

Psychological counseling needs among middle and high school students with separated/divorced parents in Hue city

Tran Binh Thang, Ho Uyen Phuong, Dinh Thi Lieu, Pham Thi Thu Ha, Chau Nguyen Dan, Nguyen Ngo Bao Khuyen, Luong Thi Thu Tham, Tran Thi Tra My, Vo Nu Hong Duc, Nguyen Thanh Gia, Nguyen Van Thong, Nguyen Minh Tam, Nguyen Minh Tu

Khảo sát tỉ lệ cận thị ở học sinh trường trung học phổ thông thực hành Cao Nguyên năm 2022 và các yếu tố liên quan

Nguyen Thanh Hai, Dao Thi My Chau, Nguyen Huu Duan, Tran The Nhan

Sự hài lòng của sinh viên ngành y khoa về chương trình đào tạo tại Trường Đại học Y - Dược, Đại học Huế

Nguyen Truong An, Vo Ngoc Ha My, Ngo Van Dong, Vinh khanh, Phan Van Thang, Ha Minh Phuong, Le Thi Phuong Thuan, Nguyen Thi Nhat Hoa, Vo Phuc Anh

Giá trị của nồng độ albumin và bilirubin máu cuống rốn trong tiên đoán vàng da tăng bilirubin gián tiếp bệnh lý ở trẻ sơ sinh non tháng

Nguyen Thi Thanh Binh, Phan Hung Viet

Nghiên cứu bào chế gel sát khuẩn tay bổ sung chất dưỡng ẩm từ cây lô hội Aloe vera

Tran Tien, Do Nhat Huy, Le Thi Minh Nguyet, Le Thi Bao Chi,Nguyen Thi Khanh Linh, Ho Hoang Nhan

Đặc điểm lâm sàng, cận lâm sàng và hình thái thần kinh VII ở bệnh nhân phẫu thuật u tuyến nước bọt mang tai

Nguyen Van Minh, Tran Thi Thuy Nhien

Risk screening, nutrition assessment and associated factors of malnutrition among elderly inpatients in Hue University of Medicine and Pharmacy Hospital

Che Thi Len Len, Hoang Thi Bach Yen, Nguyen Minh Tam

Nghiên cứu đặc điểm chức năng tạng thận theo y học cổ truyền ở bệnh nhân vô sinh có hội chứng buồng trứng đa nang

Nguyen Thi Kim Lien, Nguyen Quang Tam, Le Minh Tam, Doan Van Minh

Đánh giá kết quả phẫu thuật cắt gan điều trị bệnh lý sỏi đường mật trong gan tại Bệnh viện Trường Đại học Y - Dược huế

Nguyen Minh Thao, Pham Minh Duc, Doan Phuoc Vung, Nguyen Van Quy, Pham Anh Vu

Đánh giá kết quả điều trị mộng thịt bằng phẫu thuật xoay hai vạt kết mạc

Le Viet Nhat Hung, Huynh Thi Xuan Thao

Nhiễm giun truyền qua đất và một số yếu tố liên quan ở học sinh tiểu học tại xã Ea Pô, huyện Cư Jút, tỉnh Đắk Nông

Tran Van Thuy, Hoang Thi Minh Trang, Ngo Van Phuong, Nguyen Thi Cam Nhung

Nghiên cứu đặc điểm hình ảnh cộng hưởng từ ở bệnh nhân thoái hóa cột sống cổ và một số yếu tố liên quan

Ha Thi Hien, Nguyen Thanh Thao, Tran Hong Phuong Dung, Tran Thi Minh Ngoc

Nghiên cứu một số yếu tố nguy cơ tiến triển bệnh đái tháo đường típ 2 trong 10 năm theo thang điểm findrisc ở người dân từ 25 tuổi trở lên ở một số phường tại thành phố Huế

Doan Phuoc Thuoc, Nguyen Thi Huong, Phan Thi Thuy Linh, Nguyen Thi Thuy Hang, Le Duc Huy, Nguyen Thi Hong Nhi, Nguyen Thi Phuong Thao, Doan Pham Phuoc Long

Nghiên cứu in vitro đánh giá sự ảnh hưởng của hiệu ứng vành đai và độ sâu chốt lên độ kháng gãy của răng đã điều trị nội nha được gia cố bằng chốt sợi

Phan Anh Chi, Le Thien Phu, Nguyen Thi Dao

Tỷ lệ nhiễm nấm Candida niêm mạc miệng và yếu tố liên quan ở bệnh nhân điều trị bệnh nội khoa tại Bệnh viện Trường Đại học Y - Dược Huế

Ngo Thi Minh Chau, Phan Thi Ngoc Hoa

Đánh giá kiến thức, thái độ và kỹ năng thực hành sử dụng dụng cụ phân phối thuốc điều trị hen phế quản trên bệnh nhân điều trị ngoại trú

Vo Thi Hong Phuong, Phan Dang Thuc Anh, Nguyen Phuoc Bich Ngoc, Ngo Thi Kim Cuc, Le Van Quang, Phan Thi Hoa

Đánh giá kết quả điều trị phẫu thuật viêm tai giữa mạn tính có thủng nhĩ

Luong Si Long, Vo Doan Minh Nhat, Le Thanh Thai

Nhồi máu não cấp ở dân số cao tuổi có và không có huyết khối tiểu nhĩ trái: khác biệt gì trên cộng hưởng từ não?

Nguyen Thanh Huan, Nguyen Quang Huy, Ha Pham Trong Khang

Nghiên cứu sự bộc lộ CK7, CK20 và một số dấu ấn hóa mô miễn dịch để định típ và xác định nguồn gốc u ác tính

Tran Nam Dong, Nguyen Van Mao, Le Thi Thu Thao, Vo Thi Hanh Thao, Tran Thi Hoang Lien

Đánh giá hiệu quả an thần của propofol đơn thuần và kết hợp Fentanyl hoặc Midazolam trong siêu âm qua nội soi đường tiêu hóa trên

Pham Thi Minh Thu, Nguyen Thi Phuong Thao, Le Van Long, Nguyen Van Minh

Nghiên cứu tỷ lệ và các yếu tố liên quan đến gãy xương đốt sống không triệu chứng ở người trên 50 tuổi

Nguyen Thai Hoa, Thai Thi Hong Nhung, Tran Viet An, Nguyen The Bao, Phu Tri Nghia, Ho Pham Thuc Lan, Vo Tam

Nghiên cứu ứng dụng kỹ thuật nội soi hoàn toàn ngoài phúc mạc mở rộng trường quan sát eTEP trong điều trị thoát vị bẹn: nhân 2 trường hợp

Nguyen Thanh Phuc, Pham Anh Vu

Giá trị chỉ số iMELD trong tiên lượng sớm ở bệnh nhân xơ gan mất bù do virus viêm gan

Phan Trung Nam, Vo Hoang Nhat Tien

Nghiên cứu độ ổn định và hoạt tính kháng nấm đối với Candida albicans của gel chứa tiểu phân nano clotrimazole

Ho Hoang Nhan, Ngo Thi Minh Chau, Hoang Ngoc Tuan, Ton Nu Phuong Anh, Nguyen Thi Kieu Nhi

Nghiên cứu tỷ lệ bạch cầu đoạn trung tính trên tế bào lympho (NLR) và tỷ lệ giữa tiểu cầu trên lympho (PLR) ở bệnh nhân lupus ban đỏ hệ thống tại Bệnh viện Trường Đại học Y - Dược Huế

Hoàng Thị Anh Thu, Nguyẽn Dác Duy Nghiem, Nguyẽn Hoàng Thanh Van, Le Phan Minh Triét, Hà Nũ Thùy Duong, Nguyẽn Thanh Thu

Nghiên cứu in vitro: môi trường lưu trữ tối ưu của răng sau khi rời khỏi xương ổ răng

Phan Anh Chi, To Thanh Tin

Nghiên cứu giá trị của siêu âm trong chẩn đoán huyết khối tĩnh mạch sâu chi dưới

Nguyen Quoc Bao, Ngo Dac Hong An, Huyen Ton Nu Hong Hanh, Le Minh Tuan, Le Trong Khoan, Le Trong Binh

Khảo sát đặc điểm nuôi cấy nấm Candida spp. trên môi trường thạch sinh màu và các môi trường sinh bào tử bao dày

Ngo Thi Minh Chau, Nguyen Thi Hong Hanh

Nghiên cứu chức năng tâm thu thất trái bằng sự dịch chuyển vòng van hai lá trên siêu âm tim đánh dấu mô ở bệnh nhân bệnh tim thiếu máu cục bộ

Nguyen Anh Vu, Truong Thi Bich Phuong

Xây dựng ứng dụng nhận dạng tự động kết quả hình ảnh kháng sinh đồ của thử nghiệm khuếch tán môi trường thạch Kirby-Bauer

Nguyen Hoang Bach, Phan Thanh Luan, Ung Thi Thuy

Nghiên cứu in vitro: độ xói mòn ngà răng của các phương pháp hoạt hoá chelat quan sát dưới kính hiển vi điện tử quét

Phan Anh Chi, Le Thi Thu Nga