Trang chủ

/

Bài báo

Tạp chí Y Dược học - Số 20/2014 năm 2014

Xây dựng cơ sở dữ liệu “SpoligoBD ver4” ứng dụng trong nghiên cứu đa dạng di truyền của Mycobacterium Tuberuculosis complex

Nguyễn Hoàng Bách, Huỳnh Thị Hải Đường, Ngô Viết Quỳnh Trâm

2014 - Số 20/2014, trang 90

DOI: 10.34071/jmp.2014.2.15

Tóm tắt

Mục tiêu nghiên cứu: Xây dựng cơ sở dữ liệu (CSDL) lưu trữ toàn bộ kiểu gen spoligotype phục vụ phân tích kết quả kỹ thuật spoligotyping trong các nghiên cứu về đa dạng di truyền của các chủng vi khuẩn gây bệnh lao. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Sử dụng CSDL tham chiếu SpolDB4 từ Viện Pasteur Guadeloupe, lập trình ứng dụng bằng ngôn ngữ PHP và lưu trữ dữ liệu trong MySQL và chạy trên nền tảng web. Xây dựng các chức năng thống kê theo các trường dữ liệu khác nhau, các công cụ tìm kiếm theo các kiểu dữ liệu nhập khác nhau. Kết quả: xây dựng hoàn chỉnh CSDL SpoligoDB ver4 đáp ứng yêu cầu tìm kiếm nhanh chóng, trực quan, chính xác; phục vụ công tác kiểm tra kết quả kỹ thuật spoligotyping trong các nghiên cứu về phân loại và tính kháng thuốc của các vi khuẩn gây bệnh lao tại Trung tâm Carlo Urbani, Đại học Y Dược Huế và các đơn vị khác tại các địa chỉ sau: http://khdn-yhue.vn/modules.php?name=Spoligodb; http://carlo-urbani-center.org/en/modules.php?name=Spoligodb. Kết luận: Đã xây dựng hoàn chỉnh, đạt yêu cầu hệ CSDL SpologoDB ver4 từ dữ liệu trích xuất từ SpolDB4 cung cấp bởi Viện Pasteur Guadeloupe phục vụ phân tích kết quả kỹ thuật spoligotyping cho các đơn vị có nghiên cứu về đa dạng di truyền của vi khuẩn gây bệnh lao. Từ khóa: spoligotyping, hình vạch spoligotype, SpoligoDB ver4, AIE-VNM.

Từ khoá

Toàn văn

PDF

Trích dẫn bài báo

Nguyễn Hoàng Bách, Huỳnh Thị Hải Đường, Ngô Viết Quỳnh Trâm. (2014). Xây dựng cơ sở dữ liệu “SpoligoBD ver4” ứng dụng trong nghiên cứu đa dạng di truyền của Mycobacterium Tuberuculosis complex. Tạp chí Y Dược học, , 90. DOI: 10.34071/jmp.2014.2.15

Trong số này

Tạp chí Y Dược học thuộc Trường Đại học Y Dược- Đại học Huế được phép hoạt động báo chí theo giấy phép số 1720/GP-BTTTT ngày 15 tháng 11 năm 2010 và được Bộ Khoa học – Công nghệ cấp mã số ISSN 1859-3836 theo Quyết định số 009/TTKHCN-ISSN ngày 22 tháng 03 năm 2011

Toà soạn

Địa chỉ
Tầng 4, nhà A, Trường ĐH Y-Dược Huế
06 Ngô Quyền, TP Huế, Việt Nam

Email

tcydhue@huemed-univ.edu.vn

Phone

0234-3824663

© 2010-2023 Tạp chí Y Dược học . Cơ quan chủ quản: Trường Đại học Y-Dược Huế
Giấy phép xuất bản bản in số 1720/GP-BTTTT ngày 15/11/2010 của Bộ Thông tin và Truyền thông